设施
IHTSI拥有先进的HTS实验室,为所有人,特别是我们在食品公司的同事提供分析服务.
IFSH HTS实验室除了所有必要的设备和仪器外,还拥有两台Illumina MiSeqs和一台Oxford Nanopore MinIon测序仪,以便每个月准确快速地处理各种各样的样品和分离物.
IHTSI有自己的生物信息设施. 它目前配备了四台高性能计算机(hpc),具有令人印象深刻的计算能力,使我们和我们的合作者/客户能够处理这些测序机产生的大量数据. 我们的生物信息学设施还配备了高容量可扩展的备份系统,以安全可靠地存储大量测序和分析数据.
服务
IHTSI实验室服务
- DNA的提取、纯化和定量
- RNA的提取、纯化和定量
- 图书馆准备
- 全基因组测序(WGS)
- RNA测序(RNA- seq)
- 宏基因组学(大规模16s rDNA测序)
- 宏基因组学(鸟枪测序)
IHTSI分析服务
- 数据存储和远程访问
- 序列质量检验和过滤(质量控制)
- 序列组装(WGS、rna序列或转录组学)
- 序列装配评估(质量控制)
- 序列集合比较
- BLAST搜索和结果
- 序列注释
- 单核苷酸多态性分析
- 系统发育学和系统发育分析